ארבעה מאפיינים של פפטידים אנטי-מיקרוביאליים

פפטידים אנטי-מיקרוביאליים אלו נגזרו במקור ממערכות ההגנה של חרקים, יונקים, דו-חיים וכו', והם כוללים בעיקר ארבע קטגוריות:

1. cecropin היה קיים במקור בלימפה החיסונית של Cecropiamoth, שנמצאת בעיקר בחרקים אחרים, ופפטידים קוטלי חיידקים דומים נמצאים גם במעי חזירים.הם מאופיינים בדרך כלל על ידי אזור N-טרמינלי אלקליני חזק ואחריו שבר הידרופובי ארוך.

2. פפטידים אנטי-מיקרוביאליים של קסנופוס (מגנין) מופקים מהשרירים והקיבה של צפרדעים.המבנה של פפטידים אנטי-מיקרוביאליים של קסנופוס נמצא גם הוא סליל, במיוחד בסביבות הידרופוביות.התצורה של אנטי-פפטידים לקסנופוס בשכבות שומנים נחקרה על ידי NMR עם NMR שלב מוצק.בהתבסס על השינוי הכימי של תהודה אצילמין, הסלילים של אנטי-פפטידים של קסנופוס היו משטחים דו-שכבתיים מקבילים, והם יכלו להתכנס ליצירת כלוב של 13 מ"מ עם מבנה סליל תקופתי של 30 מ"מ.

3. defensin פפטידי הגנה מופקים מפולימאקרופגים של ארנב נויטרופילים פוליקריוטיים אנושיים עם אונה גרעינית מלאה ותאי מעיים של בעלי חיים.קבוצה של פפטידים אנטי-מיקרוביאליים הדומים לפפטידי הגנה של יונקים הופקו מחרקים, המכונים "פפטידי הגנה מפני חרקים".בניגוד לפפטידי הגנה של יונקים, פפטידי הגנה מפני חרקים פעילים רק נגד חיידקים גראם חיוביים.אפילו פפטידים להגנה מפני חרקים מכילים שישה שיירי Cys, אבל השיטה של ​​קשר דיסולפיד זה לזה שונה.אופן הקישור התוך-מולקולרי של גשר דיסולפיד של פפטידים אנטיבקטריאליים המופקים מ-Drosophila melanogast היה דומה לזה של פפטידי הגנה צמחיים.בתנאי גביש, פפטידי הגנה מוצגים כדימרים.

4. טכיפלסין מופק מסרטני פרסה, הנקראים פרסה.מחקרי תצורה מראים שהוא מאמץ תצורת קיפול B אנטי מקבילה (3-8 מצבים, 11-16 מצבים), שבהβ-זווית מחוברת זו לזו (8-11 עמדות), ושני קשרים דיסולפידים נוצרים בין 7 ל-12 עמדות, ובין 3 ל-16 עמדות.במבנה זה, חומצת האמינו ההידרופוביה ממוקמת בצד אחד של המישור, וששת השרידים הקטיונים מופיעים על זנב המולקולה, כך שהמבנה הוא גם ביופילי.

מכאן נובע שכמעט כל הפפטידים האנטי-מיקרוביאליים הם קטיוניים בטבעם, למרות שהם משתנים באורך ובגובה;בקצה הגבוה, בין אם בצורת אלפא-סלילי אוβ-קיפול, מבנה ביטרופי הוא המאפיין המשותף.