מהם פפטידים חודרים לתאים?

פפטידים חודרים לתאים הם פפטידים קטנים שיכולים לחדור בקלות לממברנת התא.סוג זה של מולקולות, במיוחד CPPs עם פונקציות מיקוד, טומן בחובו הבטחה לאספקת תרופות יעילה לתאי המטרה.

לכן, למחקר על זה יש משמעות ביו-רפואית מסוימת.במחקר זה נחקרו CPPs עם פעילויות טרנס-ממברניות שונות ברמת הרצף, תוך ניסיון לברר את הגורמים המשפיעים על הפעילות הטרנס-ממברנית של CPPs, את ההבדלים ברצף בין CPPs עם פעילויות שונות לבין NonCPPs, ולהציג שיטה לניתוח רצפים ביולוגיים.

רצפי CPPs ו-NonCPPs התקבלו ממסד הנתונים של CPPsite ומספרות שונות, ופפטידים טרנסממברניים (HCPPs, MCPPs, LCPPs) עם פעילות טרנסממברנית גבוהה, בינונית ונמוכה חולצו מרצפי ה-CPPs לבניית מערכי נתונים.בהתבסס על מערכי נתונים אלה, נערכו המחקרים הבאים:

1, חומצת האמינו והרכב המבנה המשני של CPPs פעילים ו-NonCPPs שונים נותחו על ידי ANOVA.נמצא כי האינטראקציות האלקטרוסטטיות והידרופוביות של חומצות אמינו מילאו תפקיד חשוב בפעילות הטרנסממברנית של CPPs, והמבנה הסלילי והסלסול האקראי השפיעו גם על הפעילות הטרנסממברנית של CPPs.

2. המאפיינים הפיזיקליים והכימיים והאורכים של CPPs עם פעילויות שונות הוצגו במישור הדו מימדי.נמצא כי CPPs ו-NonCPPs עם פעילויות שונות יכלו להתקבץ תחת כמה מאפיינים מיוחדים, ו-HCPPs, MCPPs, LCPPs ו-NonCPPs חולקו לשלושה אשכולות, המראים את ההבדלים ביניהם;

3. במאמר זה מוצג הרעיון של מרכז פיזי וכימי של רצף ביולוגי, והשאריות המרכיבות את הרצף נחשבות כנקודות חלקיקים, והרצף מופשט כמערכת חלקיקים למחקר.שיטה זו יושמה לניתוח של CPPs על ידי הקרנת CPPs עם פעילויות שונות על מישור 3D על ידי שיטת PCA, ונמצא שרוב CPPs התקבצו יחד וחלק LCPPs התקבצו יחד עם NonCPPs.

למחקר זה יש השלכות על עיצוב CPPs והבנת ההבדלים ברצפים של CPPs עם פעילויות שונות.בנוסף, שיטת הניתוח של מרכז פיזי וכימי של רצפים ביולוגיים שהוצגה במאמר זה יכולה לשמש גם לניתוח של בעיות ביולוגיות אחרות.יחד עם זאת, הם יכולים לשמש כפרמטרים קלט עבור כמה בעיות סיווג ביולוגי ולמלא תפקיד בזיהוי דפוסים.